Η ένταξη της Τουρκίας στο ΝΑΤΟ και η δημιουργία των παραστρατιωτικών δομών Stay Behind επηρέασε και την λειτουργία της ΜΑΗ. Στελέχη της Υπηρεσίας εκπαιδεύτηκαν (στις ΗΠΑ) από την CIA προκειμένου η Υπηρεσία να συμμετάσχει ενεργά στον αντι-κομμουνιστικό αγώνα. Η πρώτη σοβαρή εμπλοκή της ΜΑΗ σε παραστρατιωτικές επιχειρήσεις (black ops) ήταν τα Σεπτεμβριανά 1955. Αντιθέτως, η εμπλοκή της Υπηρεσίας στην Κύπρο ήταν αμελητέα καθώς η οργάνωση και ο εξοπλισμός της τουρκοκυπριακής ΤΜΤ ήταν «έργο» της Υπηρεσίας Επιθεώρησης Επιστράτευσης, γνωστή και ως Τμήμα Ειδικού Πολέμου.
Ο νόμος 644/1965 περί του Εθνικού Οργανισμού Πληροφοριών (ΜΙΤ) αποτέλεσε τομή στην ιστορία της ΜΑΗ. Το βάρος δόθηκε και πάλι στις απειλές της εσωτερικής ασφάλειας και την αντικατασκοπεία. Η περίοδος 1970 - 1999 είναι πλέον ενδιαφέρουσα για τους ερευνητές των Μυστικών Υπηρεσιών της Τουρκίας. Η ASALA, η ΤΜΤ, η JITEM, oι Γκρίζοι Λύκοι, η διακίνηση ηρωίνης, οι απόπειρες δολοφονίας του Οτζαλάν και τελικά η παράδοση του στη ΜΙΤ (Ναϊρόμπι, 1999) παρουσιάζονται με πληροφορίες που βλέπουν το φως της δημοσιότητας για πρώτη φορά στην Ελλάδα.
Η ΜΙΤ του 2026 (εκατό χρόνια μετά την ίδρυση της ΜΑΗ) διαθέτει έναν ετήσιο προϋπολογισμό 650 εκ. ευρώ και απασχολεί περίπου είκοσι χιλιάδες άτομα όλων των ειδικοτήτων. Τη δομή, την οργάνωση, τη λειτουργία και τις επιχειρήσεις της σύγχρονης ΜΙΤ έχουμε ήδη παρουσιάσει στο βιβλίο-έρευνα «ΜΙΤ – Η φωλιά του τουρκικού Παρακράτους» που καλύπτει λεπτομερώς την περίοδο 2010 - 2020. Το ανά χείρας πόνημα καταγράφει τα σημαντικότερα γεγονότα των υπόλοιπων ενενήντα χρόνων (1926 - 2009 & 2021 - 2026) των τουρκικών Μυστικών Υπηρεσιών. Με αυτό τον τρόπο οι εκδόσεις Ινφογνώμων ολοκληρώνουν συγγραφικά την έρευνα για τα εκατό χρόνια της ΜΑΗ/ΜΙΤ.

